细胞工厂在人用疫苗、动物疫苗、细胞治疗、干细胞领域等大规模细胞培养方面具有重要作用，虽然是细胞培养的主要耗材，但其在使用过程中也需要一些配件的辅助。经常用到的配件包括以下几类：

1、密封盖：盖子上边有透气孔，主要在有二氧化碳环境下使用。透气孔可以让环境中的二氧化碳进入细胞工厂，给细胞生长创造合适的生长条件。
2、透气盖：盖子没有透气孔，主要在培养箱和温室等不含二氧化碳的条件下使用，密封好的盖子可以阻止外部细菌的入侵，有助于为细胞生长营造良好的生长环境。
3、软管：包括一般软管和焊接软管，焊接软管可以热合焊接。主要用作液体的转移使用。

2层细胞工厂

4、软管夹：其作用是夹住软管，以控制液体流速，或达到节流的作用。
5、管接头：连接两个不同的软管，常见的有Y型和T型两种规格。
6、小孔转换头：适配小口细胞工厂或中孔转换盖，连接软管用于管路操作。
7、转换盖：一般包括中孔口转换盖和小孔转换盖，连接软管使用。
8、空气滤器：改善空气条件，控制进液速度。

5层细胞工厂

利用细胞工厂进行大规模细胞培养时，用到的配件主要是以上几类，此外还可能会用到操控器、培养箱、支架和推车等设备。