“边缘效应”是96孔板在使用过程中经常遇到的情况，尤其在酶联免疫反应中比较常见，这种情况会导致边缘孔内细胞的生长速度放缓，直接影响试验结果。出现这种情况可通过以下几种方法处理：
1. 预孵育：使用水浴或在将反应溶液加入至96孔板中时，将板和溶液均加热至温育温度（如37℃），就可以很容易地排除“边缘效应”，并且可提高测定的重复性。另外，有研究发现将铺好的细胞在室温先放置一个小时，待细胞完成沉降和贴壁后再放回37℃培养箱继续培养，也可显著改善边缘效应。
2. 使用防挥发盖：已有人针对多孔板挥发效应导致的边缘效应，开发了一种防挥发的多孔板盖。该多孔板盖可以在多孔板上方形成饱和的水蒸气层成为一个蒸汽屏蔽，将多孔板内环境与实验室环境隔绝，从而更好的维持多孔板处在一个相对稳定的状态下。
3. 放弃周边孔：在上述方法不能解决时，为了得到更可靠的试验结果，最直接简单的方法就是不用这些周边的孔。
以上是防止96孔板出现边缘效应的解决办法，掌握这些处理方式可以减少边缘效应对试验结果的影响。
