近年来，细胞培养技术不断成熟，细胞工厂也被越来越多的应用于细胞的大规模培养中，其中冻干型甲肝减毒活疫苗就是其应用领域的一个重要分支。
2层细胞工厂
甲型病毒性肝炎简称甲型肝炎，是由甲型肝炎病毒(HAV)引起的一种急性传染病。临床上表现为急性起病，有畏寒、发热、食欲减退、恶心、疲乏、肝肿大及肝功能异常。部分病例出现黄疸，无症状感染病例较常见，一般不转为慢性和病原携带状态。甲肝疫苗是用于预防甲型肝炎的疫苗，在中国已经成为儿童接种的主要疫苗之一，2008年5月被列入扩大免疫疫苗之一，部分省市已经提供免费甲肝疫苗接种。
5层细胞工厂
市场上的甲肝疫苗主要有甲肝灭活疫苗和减毒活疫苗两大类，其中用到细胞工厂的为冻干型减毒活疫苗。冻干型甲肝减毒活疫苗原液生产一直存在原液生产的瓶颈，而采用细胞工厂培养人胚肺二倍体细胞制备冻干甲型肝炎减毒活疫苗具有节省培养空间、减少污染风险、缩短操作时间等优势，其多层结构的设计可以大大提高甲肝疫苗的产量，已经逐步替代了转瓶，成为新一代用于疫苗规模化生产的细胞培养技术。
10层细胞工厂
此外，细胞工厂是一种重要的细胞培养耗材，还可以结合自动化设备实现智能化生产，标准化操作披肩差异相对较小，还可用于乙脑、水痘、麻疹等疫苗的生产。
