在现代细胞培养观念中，如果细胞工厂培养细胞时混入了对细胞产生有害物质或者影响细胞生长的障碍异物都会被视为污染，我们根据这一观念就可以将细胞工厂内污染分为（真菌、细菌、病毒和支原体）、化学物质（影响细胞生存、非细胞所需的化学成分）、细胞（非同种的其他细胞）。

那我们清楚了污染的类别就可以针对这些类别做污染途径细分来更好的预防污染物，特别是微生物常通过下列途径进入培养体系，造成污染。

空气：空气是微生物及尘埃颗粒传播的主要途径。空气流动性大，如果细胞工厂的培养操作场地于外界隔离不严格或消毒不充分，外界不洁空气很容易进入造成污染。因此，细胞工厂不能设在通风场所。无菌操作应在净化台内进行，工作时要带口罩，以免因讲话、咳嗽等使外界污染进入操作面，造成污染。

器材：细胞工厂破包之后在外界产生污染，另外需要对培养箱进行定期消毒，防止形成污染

操作：实验操作无菌观念不强，技术不熟练，使用污染的细胞工厂，都可以造成污染。培养两种细胞以上时，操作不规范，交叉使用吸管或培养液等有可能导致细胞交叉污染。

血清：有些血清在生产时就已经被支原体或病毒等污染，变成了细胞工厂污染。

组织样本：原代培养的污染多数来源于组织样本；取材时碘酒消毒后脱碘不彻底，可造成碘混入组织，细胞或培养液中，影响细胞工厂内细胞生长。

这就是细胞工厂产生污染的途径了，我们可以针对以上行为做针对性措施。